西历2040年。高中生熊泽晶随着升学加入【武装神姬同好会】，但想要体验神姬对战的他正面临着必须自己准备神姬的残酷现实。在前辈们的劝说下来到商店的晶邂逅了被埋在废品中的一具史特拉夫型神姬。成功启动神姬后，晶给她取名为史特拉夫零（zero），开始了所向往的神姬...