最喜欢数码兽的女高中生莉可，为了使实体化的数码宝贝玩具恢复原状，与亚古兽一起奋斗！ （男主呢？ ）

依托于数码宝贝召唤应用程序，莉拉与搭档·拉拉兽一起生活。某一天，应用程序官方发布了终止服务的消息… 本作与《数码宝贝再收集(デジモンリコレクション/Digimon Rikollection)》为同一世界观