2050年，日本被沙漠覆盖，分裂成四个独立的小国家。环境愈发恶劣，生活物资虽由政府管制，却也渐渐不足。一名士兵与一位被名为「花之少女」疾病所感染的少女邂逅了。某一天，他们被袭击了，在生死存亡之刻，少女的身体发生了变化……

故事从一艘黑夜中的赌船开始…… 男主角，伊藤开司，浑浑噩噩，一事无成，因为好心替人做了担保而背负上了数百万债务。为偿还欠款，开司接受怂恿上了一艘名为“希望之船”的渡轮，为的是参加一次神秘赌局，一旦获胜，就能将欠款一笔勾销。上到贼船后开司才发现，参与者多是如自己一般的失败青年！

1415年，布拉格神学士约翰·胡斯针对教会的腐败大肆批判，最后被当成异端份子遭到处决。因为这起事件，以圣经为基准提倡信徒平等的「胡斯派」，与强调教会威信的「天主教派」之间的对立逐渐激化。1419年爆发了后世所谓的「胡斯战争」。1420年，位在波西米亚王国的某个小村子遭到天主教派「医院骑士团」的蹂躏，村里唯一的生还者·夏露嘉遭遇失去父母又被粗暴对待，在胡斯派佣兵队长约翰·杰斯卡的引导下，决定成为一

从公立学校开始以来一直憧憬着的初高中一贯制的私立由联女子学院的绘里子、由真、绫乃三人，成为了连做梦都想着要做个又娇纵又漂亮的女子高生。可是，在那里发现了女子高中“残酷的现实”。绘里子由于受不了现实与理想的巨大差异而不由得逃跑。入学前的决心呢？作为女孩子的羞耻的心呢？与心仪男子的邂逅呢？去哪里了？！消失在哪里了？！丢弃在哪里了？？加上同班同学香田、姬路、小川共同迈向那“严酷的现实“的绘里子一行人的